Álvaro de Rújula se licenció y doctoró en Física en la Universidad Complutense de Madrid. Ha trabajado en Italia (ICTP, Trieste), Francia (IHES y Saclay, cerca de Paris), en los EEUU (Universidades de Harvard y Boston), en el CERN (en varios roles, desde estudiante de verano a líder de la División de Teoría) y en Madrid (Instituto de Física Teórica de la Universidad Autónoma).

A finales de los años 70 contribuyó en la consolidación del Modelo Estándar de las partículas elementales (o no), en particular el estudio de la Cromodinámica Cuántica, las partículas encantadas y la predicción de sus masas. Ha trabajado también en muchos otros campos, tales como radiografiar la tierra con neutrinos, medir sus masas en el laboratorio, buscar antimateria en el universo, entender los rayos cósmicos y los chorros de rayos gama y el desarrollo de los métodos sofisticados que contribuyeron al descubrimiento del bosón de Higgs.