Además de los programas propios, la Fundación mantiene colaboraciones con prestigiosas instituciones científicas y culturales.
Presta apoyo a las Reales Academias de Farmacia, Historia, Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Ciencias Morales y Políticas y Medicina; a la Real Sociedad Española de Física y a la Real Sociedad Matemática Española. Con el objeto de compartir recursos, ampliar sectores de actividad y desarrollar nuevos contenidos, la Fundación Ramón Areces ha seguido desarrollando la red de acuerdos con instituciones académicas, universidades y fundaciones de reconocido prestigio, nacionales e internacionales. Entre ellas, la Fundación Nobel, la London School of Economics, el Instituto de Tecnología de Massachusetts y el Instituto Weizmann de Ciencias de Israel.
En este marco de colaboración, la Fundación Ramón Areces forma parte de los Patronatos y órganos de Gobierno de las siguientes instituciones: